महाराज एक सुधारक की एक पादरी के खिलाफ लड़ाई की कहानी है। वर्ष 1861 है। करसनदास मूलजी (जुनैद खान) अपने पिता मूलजी भाई (संदीप मेहता), मामा और विधवा मासी (स्नेहा देसाई) के साथ बॉम्बे (वर्तमान मुंबई) में रहते हैं। करसनदास एक सुधारक हैं जो दादाभाई नौरोजी जैसे प्रगतिशील लोगों के साथ काम करते हैं। वह… a धार्मिक व्यक्ति लेकिन अंधविश्वास में विश्वास नहीं करता। उसकी सगाई किशोरी (शालिनी पांडे) से हो चुकी है और वे शादी के लिए तैयार हैं। किशोरी सबसे बड़े मंदिर के पुजारी जदुनाथजी (जयदीप अहलावत) की भक्त है ‘हवेली’ (मंदिर) बॉम्बे में। जदुनाथजी किशोरी को ‘चरण स्पर्श’ नामक समारोह के लिए चुनते हैं, जिसमें पुजारी एक अविवाहित महिला के साथ सोता है। करसनदास किशोरी को महाराज के साथ आपत्तिजनक स्थिति में देखता है और वह उससे दूर हो जाता है। वह इस प्रथा पर भी सवाल उठाता है, जिसके बारे में उसे लगता है कि यह महिलाओं का शोषण करती है। वह अपनी आवाज़ उठाने का फैसला करता है और परिणामस्वरूप, उसे उसके पिता द्वारा त्याग दिया जाता है। वह समाज को शिक्षित करने की कोशिश करता है, लेकिन उसके समुदाय के लोग महाराज को अपने परिवार की महिलाओं के साथ सोने देने में कोई बुराई नहीं देखते हैं। इसके अलावा, महाराज उसे कुचलने के लिए अपने प्रभाव का इस्तेमाल करते हैं। आगे क्या होता है, यह पूरी फिल्म में दिखाया गया है।
